由于BLAST程序提供蛋白质或核酸的查询序列跟相关序列数据库进行比对,因此,通常情况下,运行一次BLAST搜索,理论上意味着进行了成千上万次的两序列之间的比对分析。其比对结果,通过全局与局部比对算法可以找到最优化的比对结果。BLAST的应用主要包括以下几方面: 1 .确定查询序列的身份例如,在DDPCR 、基因芯片检测或差减杂交分析等实验中发现中医药对某一个特定基因的表达具有显著的调控作用,并通过测序或芯片结果的链接,得到了该基因的核酸序列,此时,就可以通过BLAST搜索,来查找该序列的身份。6 .寻找对 ......