[速览]二、根据碎片离子信息鉴定蛋白质

当仅根据PMF不能鉴定蛋白或不能确定鉴定结果是否可信时，就需要结合一个或多个肽段的碎片离子信息来鉴定蛋白质。碎片离子信息鉴定蛋白质可以以两种方法来进行。第一种方法是根据将碎片离子的质量信息进行相关数据库搜索，当一个或多个肽段的碎片离子质量谱与数据库中某个蛋白质的虚拟肽段碎片谱相匹配时，那么这个蛋白就得以鉴定。第二种方法是将碎片离子谱图进行部分解析得到部分肽段序列，然后进行ESTs数据库检索。碎片离子谱比较复杂，通常很难全部解析，根据得到的部分肽段信息及序列两端的肽质量信息即可鉴定肽段，这种方法是由Mann ......