四、抗体可变区构象模拟实例［2，3］

以抗TNF鼠源功能抗体Z12可变区构象模拟为例，介绍抗体可变区构象模拟的过程。通过http://www ﹒ ncbi ﹒ nlm ﹒ nih ﹒ gov/BLAST检索PDB数据库，搜索鼠源抗体Z12的轻、重链可变区序列VH、V κ相似性蛋白（表9‐。对获得的抗体Z12轻、重链可变区构象进行优化。在模拟抗体Z12轻、重链可变区构象的过程中，选择同一个包含轻、重链可变区构象的模板（图9‐3中的43C9）作为参考，考虑抗体可变区轻、重链的作用模式，分析可及性表面积以及表观静电分布情况，通过CDR区的表观结构特 ......