基于肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正比,因此蛋白质被质谱检测到的频次能反映蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测频次与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。基于肽段数的定量方法包括肽段序列覆盖率、肽段计数、SpS模型、PMSS模型、PAI模型以及emPAI模型等。肽段序列覆盖率指所鉴定肽段的氨基酸序列长度占该蛋白总的长度的百分比,由于该方法依赖蛋白质序列的长度和酶切模式,所以不能得到相对准确的定量信息。 ......