HSV基因组为一线性DNA分子,由共价连接的长片段(L)和短片段(S)组成,每一片段均含有单一序列和反转重复序列,长重复序列(RL)和短重复序列(Rs)中含有命名为a的末端重复序列,由约400bp组成,在L和S片段之间,插有a的反转重序列,称为a ’。HSV-1的基因组上,共排列有72个编码蛋白的基因,其中长单一序列(UL)上有56个、短单一序列(Us)上有12个、Us末端反转重复序列(TRL)、Us末端反转重复序列(TRs)、UL中间反转重复序列(IRL)和Us中间反转重复序列(IRs)上各. ......