Helicos和Pacific Biosciences都是基于单分子测序原理通过掺入并检测特殊荧光标记的核苷酸来进行测序。最近,Oxford Nanopore的纳米孔(nanopore)测序技术的主要原理是根据α-溶血素纳米孔,环式糊精共价结合在α-溶血素纳米孔的内侧。核酸外切酶消化单链DNA产生的单个碱基落入孔中,溶血素纳米孔和共价结合的环式糊精瞬间结合落入孔中的单个碱基,因此引起了穿过孔中的电流变化。主要应用包括转录组测序、RNA定量分析、microRNA筛选和鉴定、基因组深度测序、甲基化分析和ChI ......