前面讲述的蛋白质鉴定方案都是通过将蛋白质酶解成肽段,然后通过肽段的信息推导蛋白质的信息,统称为自下而上(bottom-up)策略。自上而下(top-down)的蛋白质鉴定策略则是通过整个蛋白离子的气相解离来直接获取其序列信息,无需进行酶解,不会对蛋白质的修饰信息造成破坏。这种蛋白质鉴定方案可获得更大质量的肽段信息,因而鉴定结果更特异,另外,这种方法常采用FTMS来完成,结果的精度非常高,假阳性率远低于自下而上的策略。有人采用部分酶解与Top-Down相结合的策略,也可以实现对特别大的蛋白质或者针对某个蛋白 ......