二、DNA序列标记数据的处理与分析

DNA序列标记分析是根据核酸一级结构中核苷酸序列组成来比较类群之间相互关系来体现。首先利用NCBI的数据库检索查询系统，通过Blast分析，判断被测序列的可靠性，进一步参照GenBank中公布的同科属或亲缘关系相近科属的序列资料，确定每种植物被测基因组DNA特定区域的起止范围。然后将所有需要比较分析的序列用CLUSTAL X软件进行对位排列，排序后的序列使用MEGA （ molecular evolutionary genetics analysis ） 2.1或者PAUP4.0分子进化软件进行序列差异与 ......