[速览]三、根据肽段从头测序鉴定蛋白质

生物体内蛋白质从合成到成熟常常会发生剪切、加工、翻译后修饰等，而蛋白质数据库却是根据基因理论推导的，与实际的数据会有偏差，因而很多蛋白根据PMF、肽段碎片离子质量或肽序列标签进行数据库搜索常常无法得到鉴定。在这种情况下，就可以对肽段碎片离子谱图进行解析，得到肽段的完整氨基酸序列，进而根据肽段的序列确定蛋白质的序列，这种测序方法称之为de novo sequencing，即从头测序。沿着肽骨架断裂产生的离子，即b离子和y离子才真正代表着连续的或完整的氨基酸链，因而从众多碎片中辨别b离子和y离子是非常重要的。 ......