ChIP-chip是将DNA芯片与ChIP实验相结合在全基因组或基因组较大区域上高通量分析技术,一方面用于分析转录因子的DNA结合位点。另一方面用于基因位点特异的组蛋白修饰模式研究。利用这一技术,有可能实现同时解析出1个转录因子的上百个靶基因,也可以对位点特异性乙酰化或甲基化组蛋白在基因组范围内所覆盖的基因区域进行探测。最理想的用于ChIP的DNA芯片是能够覆盖全基因组,这样才不至于遗漏转录因子或修饰化组蛋白的结合序列。目前,已经有一些来自不同物种的专用于ChIP-chip的选择性芯片上市,如启动子芯片、 ......