小 结

多序列比对是双序列比对的自然推广，许多算法是基于双序列比对的，采用的计分方法也类似，因此本质上的创新不多。不过，在实际的基因组分析中，所做的大部分序列比对是多序列比对，这使得多序列比对技术得到了更多样化的发展[ 1]。即便所关心的只是两个序列间的进化关系和功能单元的对应性，如果这两个序列种系跨度较大，采用更多的相关的或介乎于它们之间的物种的序列连同进行多序列比对也常常是必不可少的。关于多序列比对的质量，动态的质量控制是一个重要方向，它对于复杂的基因组序列比对尤其重要，在这方面已有了若干的进展[ 15，16 ......