SARS冠状病毒基因组为正单链RNA,是所有RNA病毒中最大的,长约27~32kb。病毒RNA链具有一个正链RNA病毒特有的重要结构特征,即RNA链5 ˊ端有甲基化帽(methylated cap),在其5 ˊ端帽子结构之后是60~80个碱基的先导序列和200~500个碱基的非编码区。后1 / 3的序列,编码病毒结构蛋白,如S蛋白、E蛋白、M蛋白、N蛋白,但目前尚有多个开放读码框(open reading frame , ORF)编码的蛋白结构与功能未知,这种未知蛋白(predicted unknown ......