第四节 基因集合富集分析

已建立的基因及其产物注释数据库包含了丰富的知识和复杂的结构，促使研究人员开展以注释数据库为知识基础的基因功能研究，以便更好地利用注释系统。一组基因直接注释的结果是得到大量的功能结点。这些功能具有概念上的交叠现象，导致分析结果冗余，不利于进一步的精细分析，所以研究人员希望对得到的功能结点加以过滤和筛选，以便获得更有意义的功能信息。目前最常用的方法是基于GO或KEGG的富集分析。人们通过多种方法获得大量的感兴趣基因，如差异表达基因集、共表达基因模块、蛋白复合物基因簇等，然后寻找这些感兴趣基因集显著富集的GO结 ......