EV71病毒是具有遗传多样性并不断进化的病毒,具有高突变性,变异率与脊髓灰质炎病毒类似,约为1.35 × 10 - 2/核苷酸。EV71病毒的基因亚型与分离地区和分离时间有一定的关联,但由于EV71亚临床感染的高发,大量病例被漏查,因而不可能对流行的每一株病毒进行详细分析,进入分析的毒株并不能代表整个地区或国家,EV71病毒确切的进化史不得而知。结果显示,该地区的流行株先后为C1(1990年)、B2(1990年和1993年)、C2(1997 — 1999年)、B4(2000年)、C4和B5(2003年)以 ......