一种miRNA所能结合的mRNA称为其靶基因(target gene)。由于miRNA与靶基因mRNA的结合可以是完全互补的,也可以是不完全互补的,一个miRNA可以有多个不同的靶基因,所以确认miRNA的靶基因是研究miRNA功能的关键。MiRNA与靶基因mRNA的相互作用是基于碱基互补原理,利用这一特点,研究者可利用生物信息学的方法对miRNA可能的靶基因进行预测,再利用实验的方法对预测到的潜在靶基因进行验证。证明靶基因需要在RNA和蛋白水平上检测这些靶基因的表达,还可利用报告基因系统对靶基因进行验证 ......