质粒是细菌染色体外小型双链环状DNA复制子。碱性SDS裂解使质粒DNA从细胞中释放出来,而细菌染色体DNA留在细胞壁碎片上。在pH 12 ﹒ 0~12.5的碱性条件下,共价闭合环状的质粒DNA由于拓扑缠绕,两条互补链并不分开。当调节pH至中性时,质粒DNA大部分恢复其原来的共价闭环构型(CC型),一部分可能已造成单链缺口,但仍保持双股环状结构(OC型)。染色体DNA却不能复性到原来的双螺旋结构,这些单链染色体DNA常缠绕在细菌碎片上,通过在10 000r/min离心,可把细菌残片及缠绕于其上的变性细菌染色 ......