分子对接(molecular docking)是从已知结构的配体与受体分子出发,通过模拟分子的几何结构和分子间的相互作用,预测其结合模式的方法。对获得的结构进行能量优化,允许氨基酸残基侧链和骨架的柔性运动。通过合理有效的打分函数对近天然构象进行评价、排序和挑选。根据简化程度的不同,分子对接方法可以分为3类:刚性对接、半柔性对接和柔性对接。 ......