第四节 蛋白质序列模式和序列结构域模式

蛋白质序列分析的最基本方法是针对PIR等序列数据库类似性检索和序列配准比较。但是，有时被检序列与数据库中的任何序列的类似性都极其微弱，难以肯定它们的同源关系。由于蛋白质的不同部分其进化速率可能不同，功能重要的部分（如，酶的活性位点）进化得慢，即在不同序列中保守性好。因此在远缘的序列中有可能发现某种共同的保守序列片段，从而揭示某种结构或功能关系。有些位置上的残基可以是某个类型或任意类型的残基。 ......