但由于广东省《预防接种异常反应补偿办法》仍在制订中,解决补偿问题的方式主要依靠协商。由于患儿家属提出的补偿数额较大,且态度坚决,短时间妥善处理该事件难度较大。患儿家长两次提交书面赔偿申请,首次提出要按医疗事故处理,赔偿人民币1 303 277 ﹒ 32元、将患儿户口转为深圳户籍、在深圳免费入学、减免患儿家属的个体经营税务、申请廉租房等。整个协商过程异常艰辛,从3月到7月的整整5个月的时间里,协商小组与患儿家属协商27次,出动工作人员达89人次。