基因多态性会影响药物治疗消化性溃疡的效果,目前研究较多的主要是质子泵抑制剂。质子泵抑制剂作用于H +/K + ATP酶,抑制胃酸分泌最后一步质子泵的功能,是目前治疗消化性溃疡、反流性食管疾病和佐林格‐埃利森综合征的最重要药物。比较研究证实,质子泵抑制剂在胃酸抑制、缓解疼痛和溃疡愈合方面的疗效优于组胺H2受体拮抗剂。消化性疾病的药物基因组学研究除了质子泵抑制剂外,其他药物如H2受体阻断剂、M受体阻断剂等的研究尚较少,并存在一些矛盾的研究结果,也需要进行进一步的研究。