MALDI‐TOF‐MS与蛋白水解相结合用于分析p21‐B溶液和p21‐B与Cdk2 1 ∶ 1混合物的激酶抑制性结合区的水解。非共价复合物的形成则与蛋白本身的低聚核苷酸碱基及氨基酸组成有关。Birendra等讨论了用ESI检测分子量在19~34ku的非共价复合物,研究的内容包括:①蛋白‐配体相互作用(以ras蛋白与二磷酸鸟苷(ras‐GDP)间的相互作用为例)。在这些例子中,ESI‐MS法均能使非共价复合物由原始溶液状态变为气相的多电荷离子。研究表明,用ESI‐MS对共价复合物研究的成功关键在于严格控制ESI源的参数(如小孔电压)及样品溶液的条件(如溶液pH值及避免使用有机助溶剂等)。
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