氨基糖苷类一旦通过细菌内膜进入胞内,可迅速与细菌核糖体(主要为30S亚基)不可逆结合,抑制蛋白质合成,也使mRNA密码错译、异常氨基酸引入延伸中的肽链,合成异常的蛋白质,该转运过程为能量依赖性,称为Ⅱ期转运系统(EDP Ⅱ)。异常蛋白质进入胞膜,使胞膜断裂,细胞内的钾离子、腺嘌呤、核苷酸等重要物质外溢,导致细菌死亡。