3﹒理论板数和分离度

电泳分离是以溶质的淌度差异为基础，而分离两个电泳区带所必需的淌度差异取决于区带的长度。在电泳分离过程中，溶质由于在介质中的扩散而引起区带展宽。在理想的条件下（即小的柱塞式进样，无溶质与管壁的相互作用等等），溶质区带展宽的唯一因素是纵向分子扩散。由于电渗流是平流型的，径向扩散对区带展宽的影响可以忽略，且毛细管的抗对流特性，对流引起的区带展宽也不明显，因此，电泳分离效能（以理论塔板数N表示）可以同色谱分离中的分子扩散项联系起来，得毛细管电泳分离效能的基本表达式：3‐。因此，为了优化分离，应控制电泳操作条件，使其在尽可能短的分析时间内获得足够好的分离度。