二、分子力学

随着计算机科学的迅速发展和研究体系的尺度的增加，分子力学（molecular mechanics，MM）已成为当前化学家经常使用的研究手段，也是分子模拟方法的重要组成部分。为了解决上述矛盾，科学家们将量子力学从头算方法与分子力学方法有机地结合起来，对于体系中重要的、牵涉到化学键变化的部分，也就是活性中心，使用量子力学从头算方法来描述。这种方法就是量子力学和分子力学联用方法，简称QM／MM方法。经过随后近三十年的改进，QM／MM方法已经从理论探讨逐渐走上实践应用，为配体‐受体相互作用和酶催化反应机制的研究提供了新的计算途径。