融合蛋白(fusion protein)是含有插入来自病原体决定簇的非毒性蛋白,将表达决定簇的DNA序列插入到载体蛋白基因中,然后融合蛋白被纯化。同亚单位疫苗、重组活疫苗和多肽疫苗一样,融合蛋白属于基因工程疫苗。