高尔基体在蛋白质翻译后修饰和蛋白质的转运分选中发挥重要作用,而且也参与了细胞内信号传导途径。第一个高尔基体蛋白质学研究是Taylor等将从大鼠肝脏纯化的高尔基体蛋白用Triton X‐114分级成不溶性、水溶性和去垢剂性溶剂,之后用双向电泳和PMF、串联质谱对3个组分蛋白质进行分离鉴定,总共鉴定了93个蛋白质:52个已知蛋白和22个未知蛋白。利用蛋白多维鉴定技术(MudPIT)分析大鼠高尔基体蛋白质组,最后鉴定了421个蛋白质,121个是高尔基体滞留蛋白,其中的71个含有跨膜域。一项研究利用此方法构建了溶酶体蛋白的2‐DE参考谱,又比较了在用佛波酯处理人U937细胞后溶酶体蛋白质的变化。
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