菌群的构成受宿主和环境的影响较大,菌群对药物的代谢作用也受这些因素的影响,结果较为复杂。RowIand等探讨了把具有人粪便菌丛的大鼠作为人菌丛的在体模型来应用的可能性。这个方法把细菌维持在与人肠管类似的在体环境,在研究肠内细菌对外来化学物质活化方面的作用上起到了相当好的效果。从胃排出、蠕动、排便的过程中,微生物菌丛的一部分成员从肠道被排出。这种类型的培养系统,可用于大鼠、小鼠、人等的大肠存在的细菌混合菌丛的体外保持。上述结肠菌丛的连续培养模型,对于研究在长时间内细菌的相互关系以及其转化是十分有用的模型。故此,体外系统,在研究哺乳类以及微生物等的酶所致外来化合物活性化、毒性和药效方面是不太适宜的模型。
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