前面介绍的是以生化手段进行的亚细胞蛋白质组学,而定位组(localizome)是主要利用遗传学方法来研究亚细胞蛋白质组。第一个研究采用拓扑异构酶Ⅰ介导的直接克隆、全基因组转座子突变策略和免疫荧光技术定位了2744个酵母蛋白质。第二个研究则利用寡核苷酸指导的同源重组将绿色荧光蛋白标记插入染色体,荧光显微镜检测定位了4 156个酵母蛋白质,代表了整个酵母蛋白质组的75%。还有报道在亚核水平上做大规模的蛋白质定位研究,他们采用基因捕获筛选策略将100多个细胞核蛋白质定位到亚核结构上。通过亚细胞蛋白质组对蛋白质进行定位分析已经有了探索性研究。这种蛋白定位策略可以应用于细胞器功能和蛋白运输的研究中。
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