口服吸收差的药物大部分自粪中排出体外。抗菌药物尚可自唾液、泪液、支气管分泌物、痰液、乳汁等体液中分泌排出。除口服不吸收的抗菌药物外,大多抗菌药物的粪浓度较尿浓度为低,但某些由肝胆系统排泄,并有肝肠循环的药物则粪便中浓度亦很高,如红霉素、四环素、利福平等。药物浓度常低于治疗水平,因此需选用在该类组织或体液中分布良好的药物,如化脓性脑膜炎、前列腺炎、骨髓炎等感染,需根据病原菌及药物分布特点,选用适宜的抗菌药物方能清除感染灶内病原菌。