沙眼衣原体是最常见的性传播病原体,几乎仅对人类致病。种内血清学变型A、B、Ba和C与地方性沙眼有关。地方性沙眼是可预防的失明的最常见表现形式。男性和女性均能发生直肠炎和结膜炎。女性感染衣原体可引起宫颈炎、尿道炎、子宫内膜炎、输卵管炎。致病力低,刺激免疫作用弱,但传染性强,并有逃避宿主防御作用的能力。