Tr EMBL蛋白质数据库是由EMBL中的编码序列翻译得到的蛋白质序列。REM‐Tr EMBL包括其他剩余条目,有免疫球蛋白、T细胞受体、少于8个氨基酸残基的小肽、合成序列和专利序列等。这两种数据库的数据是通过计算机程序的翻译获得的,因此序列错误率较高,冗余度较大,随着核酸序列数据库的更新而更新,蛋白质序列未经实验证实,也没有详细的注释。