尽管从理论上来说,哌甲酯经过细胞色素P450 2D6酶代谢,但在人体内并未发现此过程,可能是因为大部分哌甲酯通过首过效应代谢而不再经过肝脏代谢。与苯丙胺一样,哌甲酯不应同时与MAOIs合用以避免高血压危象。同时也能增强拟交感神经类药物的活性,拮抗抗组胺药和苯二氮类药物的镇静催眠作用。但总体来说,哌甲酯还是一个比较安全的药物,毒性小,药物相互作用也较小。