二、基于蛋白质结合界面的药物设计

如何以蛋白‐蛋白作用界面为靶点进行药物设计已日益得到重视，成为药物设计领域中一个新兴的有待探索的方向。但同时应看到与小分子药物结合靶的情况不同，蛋白‐蛋白结合界面面积大，情况复杂，结合前后构象变化较大，现有的药物设计方法不能直接利用，因此也给药物设计提出了新的挑战，其中需要解决的关键问题有：①蛋白‐蛋白作用界面分析。蛋白‐蛋白相互作用过程中的构象变化,特别是作用前后主链及侧链的构象变化。在小分子模拟物方面，最近发现G蛋白和它们的调节剂phos‐ducin之间存在着面积为1 500A2表面介导的相互作用界面可被小肽所模拟［ 46 ］，这一方法若得到推广，在药物可干预调整的作用靶方面将产生一全新的研究领域。