脑膜炎球菌归属奈瑟菌属(neisseria meningococcus),为革兰阴性球菌,成双排列,呈肾状。从咽部带菌者和脑膜炎球菌病患者中新分离的脑膜炎球菌含有菌毛,这对其附着在人类鼻咽部柱状细胞上有重要作用。