偶有中枢兴奋、皮疹、尿潴留、瞳孔缩小、乳汁分泌减少,并可引起可逆性中毒性精神病。本品有抗胆碱作用(阿托品样作用),可减弱胆碱酯酶药(如安贝氯铵、新斯的明、地美溴铵、依可碘酯等)的缩瞳效果。与儿茶酚胺类药物合用赛庚啶能抑制神经元对儿茶酚胺的摄取、使游离的儿茶酚胺量增加。苯妥英钠、扑米酮、乙醇与赛庚啶合用,可相互增强作用。赛庚啶若与硝酸酯类药物(如硝酸甘油、硝酸戊四醇酯等)合用,可增强赛庚啶的作用或延长其作用时间。本品与糖皮质激素合用可减弱糖皮质激素的作用,同时增强赛庚啶的抗过敏作用。