自发报告系统在上市药品安全性监测中的基本作用是产生风险信号(风险信号是指尚未完全证明的药品与不良反应相关的信息)。自发报告系统在监测A型和B型不良反应时尤为有效,此外,还可监测药物相互作用、药品本身缺陷,并能监测所有上市药物和所有患者的用药。对C型不良反应不敏感(一些潜伏期长、用药与反应出现时间关系尚不清楚的药品不良反应如致癌反应,或者药品能提高常见病发病率的反应列为C型反应)。许多因素会影响自发报告系统的成功运作,如使用药物的人数、药物注册的政策、医务人员的培训、监测中心的服务等等。