急性感染性心内膜炎常因化脓性细菌侵入心内膜引起,多由毒力较强的病原体感染所致。金黄色葡萄球菌、肠球菌、表皮葡萄球菌、革兰阴性菌或真菌的比例明显增高,厌氧菌、放线菌、李斯特菌偶见,两种细菌的混合感染时有发现。真菌、立克次体、衣原体、病毒等,亦有少部分患者感染。