一般而言,药物产生作用依赖两个因素:药物对靶部位的作用强度和靶部位的药物浓度。因此药物的化学结构不同,既可通过影响药物的药代动力学过程影响药物作用,也可通过直接影响药物对靶部位的作用而影响药效。药物的药动学过程是一个非常复杂的过程:给药过程不同引起吸收差异,不同化学结构的药物的代谢途径不同等。其间涉及的许多通道、酶及辅助因素等专一性较差,对药物化学结构不敏感。因此,若单从药物代谢动力学角度考虑,大多数情况下,对药物效应影响的最大因素应为药物本身的物理化学性质。