消化系统真菌病主要为深部真菌感染,常见致病菌为白色念珠菌、新型隐球菌、荚膜组织胞浆菌和皮炎芽生菌等。由于广谱抗生素、免疫抑制剂、肾上腺皮质激素等广泛应用,特别是艾滋病的传播。机体免疫力低下,使深部真菌发病率上升。目前仍缺乏高效且使用安全的抗真菌药,深部真菌病的治疗仍很困难。