对奈瑟淋球菌感染有效的药物种类很多,抗生素中包括青霉素类、头孢菌素类、氨基苷类、四环素类、大环内酯类及酰胺醇类药物,合成的抗菌药中有磺胺类和喹诺酮类药物。对头孢曲松钠、大观霉素耐药的菌株也时有出现,必要时应结合药敏结果选择敏感药物。