感染根管经过机械方法处理后,其根管侧壁牙本质深部,侧支根管和根尖周围等处,仍然有细菌等病原刺激物,因此需要再用药物进行根管消毒,提供一个不适于细菌生长的根管环境。理想的根管消毒药应具备的条件是能快速地消除和破坏根管内的细菌,不易产生耐药性,对多种细菌有效。这种毒性对宿主细胞和细菌细胞是非选择性的,如果医师使用不当,可能造成严重的根尖周组织损伤,影响愈合。常用的根管消毒药包括酚类、醛类、碘制剂、氯制剂和抗生素类。