不同性别在解剖学、生理学等方面有很大差异,导致药物作用呈性别差异。女性一般体重较轻,肌肉较少,相同剂量下药物作用强度会与男性有区别。女性脂肪组织比例较男性高,脂溶性药物的分布会不同于男性。有些药物的消除也有性别差异。例如,对乙酰氨基酚、阿司匹林的清除率女性较男性分别低40%及60%。月经期妇女服用泻药和抗凝血药可导致盆腔充血、月经增多,孕妇则可能引起流产。对致畸药物如锂盐、乙醇、华法林、苯妥英及性激素等,妊娠妇女应严禁使用。