真菌病的诊断,主要是以在临床标本中找到菌丝、孢子或其他形态的结构作为主要依据。而菌种的鉴定,则以它们的菌丝特征、孢子、分生孢子柄、繁殖器官和色泽等特征为鉴定依据。一般只要在临床标本内找到或培养出致病的真菌,即可协助临床作出正确诊断。然而,有时患者的临床表现、病史描述虽极似真菌性感染,但其临床标本或病变组织中未查到致病真菌,这时则应采取其他检查方法,如免疫学方法、分子生物学方法等。据CDC报告,补体结合试验及乳胶凝集试验是诊断荚膜组织胞浆菌病应用最广泛的血清学方法。由于存在抗原交叉或其他干扰因素,亦可呈现一定的假阳性反应。
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