生物体的基本单位是细胞,而细胞生命活动基本上是蛋白质相互间网络式反应与结构的表现。同样的在应用方面,由于与基因组研究相比,对蛋白质组的研究更加贴近生命现象的本质,所以蛋白质组学研究将为理解细胞、机体健康与疾病的分子基础提供启示,并必将使对生命活动的更深入的理解和更直接的干预成为可能,并对人类生活诸多方面产生重大影响。几乎所有的生理、病理过程,以及药物和环境因子的作用都依赖于蛋白质,并引起蛋白质组变化。反过来,对蛋白质组变化的分析也就能提供对上述各种过程或结果的重要信息。