4﹒2﹒1﹒4 蛋白质结构预测

三维数据库搜寻和全新药物设计方法都是基于生物大分子（特别是蛋白质）结构的药物设计方法。目前测定蛋白质空间结构的主要方法是X射线衍射技术和核磁共振方法，用X射线衍射的方法测定一个蛋白质分子的晶体结构不仅需要首先得到高质量的晶体，还要花相当长的时间，在技术上也受到一定的限制。虽然多维核磁共振技术的出现提供了一个在溶液中直接测定蛋白质三维结构的强有力的手段，但这种方法对样品的需要量大、纯度要求高，被测定的蛋白质的分子量一般不超过20000等原因，在应用上也受到很大的限制。所以仅仅依靠X射线衍射技术和NMR方法已远远不能满足对蛋白质结构数据分析的需要。