[文献资料]一、蛋白质序列比对方法

由于序列比对方法不仅是蛋白质天然构象预测中一种最基本的方法，而且它也是生物大分子序列分析的基本手段。它在这两个领域中所起的作用是一样的，即寻找待预测蛋白质与模板蛋白质之间的保守区。为此，我们首先介绍为什么要对生物大分子进行序列分析（sequence analysis）。前面我们曾提到与蛋白质序列分析相比，DNA序列因为其分化速度比较快而相应的比对所获取的信息要少得多，所以生物序列分析中一般以蛋白质序列分析、比对占多数，因而，这里仅介绍与蛋白质有关的常用得分矩阵。图10‐7B序列S ＝ ACCTGA和T ＝ CATGTAT之间的各碱基之间的局部比对结果。