为进行网络药理学分析,研究人员通过整合基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学等层面的数据,先后建立了多种网络药理学分析模型,包括药物与靶点蛋白二部图模型,基于转录组学的药物基因调控网络,细胞信号通路模型,代谢途径模型,蛋白质相互作用网络。以及基于副作用相似度的药物‐药物网络等模型。药物曾经集中作用在一小部分蛋白质靶点上,通过网络药理学网络定量分析也证实了这点。研究人员将药物靶点定位于蛋白质相互作用的网络,分析发现药物作用的靶点比一般的蛋白质节点具有更多的连接,但比网络中关键节点的连接数目少,该结果具有统计学显著性。
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