对于具有两个以上作用位点的客分子而言,当形成1 ∶ 1型包合物时,环糊精与其每个作用位点都可以结合,同时形成1 ∶ 1型包合物的不同异构体,此时的结合常数K1 ∶ 1应为所得各异构体结合常数之和。环糊精与每个作用位点都有一定的结合,但作用程度并不相同,实际在环糊精包合物形成的过程中总存在一个最佳作用点,例如4‐Cl取代苯酚及其阴离子的主要结合点为4‐Cl取代基团。这充分证明了分子结构是药物与环糊精相互作用中非常重要的因素。