日本科学家Hiroaki Kitano发表在美国《科学》周刊上的关于系统生物学的综述中,对系统生物学的研究内容作了全面的概括,它包括:系统结构、系统动力学、控制方法和设计方法[ 5 ]。虽然目前在控制方法和设计方法的方面研究得较少,但在不久的将来,当对系统的结构和系统动力学的研究有一定基础后,这两方面的研究将成为有价值的热门课题。系统生物学的建模领域正在飞速发展,软件基础资源也紧步相随,目前世界上已有许多工作平台以及模型资源库供科学家利用。系统生物学工作平台(biology workbench)就是这样一种计算生物学工具。系统生物学图解表示法(systems biology graphical notation,SBGN),定义了一种人可读的表示法。
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