精神分裂症患者存在认知功能缺损,且存在神经元丧失及脑结构异常,已有证据显示,精神分裂症患者大脑左侧额叶皮层BA9、46区域的Apo E含量显著高于正常人,Apo E水平的改变可能与精神分裂症的病理有关。4携带者发病较早,尤其携带ε 4的女性患者发病则提早4年,且往往以阴性症状为主,提示预后不佳,相反携带ε 3的精神分裂症患者发病年龄晚。结果显示,有妄想、抑郁心境、攻击行为症状组的ε 4/x基因型频率高于无症状组,有幻觉症状组的ε 4/x基因型频率低于无症状组,但这种差异无统计学意义。